Un dels símbols de la Facultat és el vaixell "San Carlos", maqueta contruida al 1769 i encara al vestíbul de l'edifici. Cal recordar que el disseny d'aquest espai central de l'edifici es va pensar per tal que pogués acollir de manera adequada aquest navili. Tanmateix no és l'únic. Actualment a l'escola també hi ha el model del bricbarca anomenat "Pepito".

Si bé està documentat que durant la República l'Escola de Nàutica va tenir un vaixell escola anomenat "Rosa dels vents", actualment, els estudiants disposen del veler "Barcelona" per navegar i fer pràctiques i, durant la primera dècada del 2000, també utilitzaven l'embarcació "Payara".

Així mateix, els velers i les regates i la construcció d'embarcacions, són una constant en l'aprenentatge al llarg de la història de la institució.